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            人類基因圖譜的完成得力資訊科技的幫助

            作者:黃俊義 時(shí)間:2000-06-28 來源:CTIMES 收藏

            Celera Genomics、Sanger Centre和Whitehead Institute以及美國(guó)健康協(xié)會(huì)(National Institute of Health)日前宣布,已經(jīng)完成人類排序,并強(qiáng)調(diào)這項(xiàng)歷史性的科學(xué)成就,得力於的卓越運(yùn)算技術(shù)。這項(xiàng)歷史性的研究所使用的超級(jí)電腦,就是執(zhí)行Tru64 UNIX以及TruCluster軟體的Compaq 。

            本文引用地址:http://www.biyoush.com/article/184397.htm

            Celera執(zhí)行長(zhǎng)J. Craig Venter在美國(guó)表示:「這是人類有史以來,首度以線狀形式排列人體?!笴elera將32億對(duì)依照正確順序排列,完成了迄今最大的運(yùn)算挑戰(zhàn)。

            在排序過程中,Celera采用了超過600個(gè)康柏Alpha伺服器,每秒可執(zhí)行將近一兆個(gè)作業(yè)程序,由於演算作業(yè)與資料儲(chǔ)存需要64 gigabytes的分散式記憶體,所以最後的排序運(yùn)算采用康柏全新AlphaServer GS160。

            位於英國(guó)的Sanger Centre,乃由Wellcome Trust與英國(guó)醫(yī)學(xué)研究評(píng)議會(huì)(British Medical Research Council)共同成立,在研究過程中需要能夠承擔(dān)繪制基因圖譜與編排人類基因序列挑戰(zhàn)的運(yùn)算架構(gòu)。於是,Sanger資訊技術(shù)主管Phil Butcher提出了三項(xiàng)選擇原則:延展性、適應(yīng)性以及發(fā)展彈性。

            Sanger最初的架構(gòu)包括160臺(tái)康柏Alpha工作站、4套康柏AlphaServer 1200系統(tǒng),和一個(gè)可執(zhí)行BLAST (基本的本地排序搜尋工具)的小型個(gè)人電腦叢集,支援網(wǎng)際網(wǎng)路基因資料庫(kù)的搜尋存取。

            該中心不斷地補(bǔ)強(qiáng)運(yùn)算基層架構(gòu),最後總共采用了將近250部執(zhí)行Tru64 UNIX的康柏AlphaServer與工作站、1部擁有4個(gè)TeraByte磁碟空間的StorageWorks Raid系統(tǒng)、1部300 GB Network Appliances Raid子系統(tǒng),以及48臺(tái)康柏Deskpro個(gè)人電腦。

            本文由 CTIMES 同意轉(zhuǎn)載,原文鏈接: http://www.ctimes.com.tw/DispCols/cn//%E5%BA%B7%E6%9F%8F%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA/%E9%9D%9EPC%E4%B8%BB%E6%9C%BA/%E4%B8%80%E8%88%AC%E6%80%A7%E4%BC%BA%E6%9C%8D%E4%B8%BB%E6%9C%BA/0006281640ZB.shtml



            關(guān)鍵詞: AlphaServers 康柏電腦 基因

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